Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms