Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FANCD2Q9BXW9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCD2Q9BXW9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms