Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms