Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG2

NUDT12, Peroxisomal NADH pyrophosphatase NUDT12, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT12Q9BQG2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUDT12Q9BQG2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms