Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SENP8Q96LD8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms