Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJA4Q8WW22 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJA4Q8WW22 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJA4Q8WW22 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJA4Q8WW22 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJA4Q8WW22 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNAJA4Q8WW22 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJA4Q8WW22 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJA4Q8WW22 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNAJA4Q8WW22 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms