Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKAP1Q86WV1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms