Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms