Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATL3Q6DD88 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms