Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM69BQ5VUD6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms