Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms