Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNT1Q5JUK3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms