Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms