Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms