Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms