Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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