Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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RTL8BQ17RB0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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