Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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