Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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ECM1Q16610 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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ECM1Q16610 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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ECM1Q16610 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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ECM1Q16610 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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ECM1Q16610 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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ECM1Q16610 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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ECM1Q16610 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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ECM1Q16610 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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