Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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