Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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