Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NEDD8Q15843 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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