Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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