Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARHGEF6Q15052 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms