Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3GAP1Q15042 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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