Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAM2Q15035 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TRAM2Q15035 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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TRAM2Q15035 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRAM2Q15035 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAM2Q15035 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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