Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOFQ13790 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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APOFQ13790 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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APOFQ13790 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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APOFQ13790 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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APOFQ13790 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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APOFQ13790 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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APOFQ13790 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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APOFQ13790 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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APOFQ13790 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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APOFQ13790 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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APOFQ13790 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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APOFQ13790 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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APOFQ13790 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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