Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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