Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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TUBA3CQ13748 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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TUBA3CQ13748 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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TUBA3CQ13748 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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TUBA3CQ13748 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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TUBA3CQ13748 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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TUBA3CQ13748 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TUBA3CQ13748 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TUBA3CQ13748 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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