Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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