Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P3Q13401 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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