Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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