Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms