Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPAL4Q0D2K0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms