Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA3Q08378 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms