Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP7AQ04656 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms