Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms