Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PKD1P98161 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PKD1P98161 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PKD1P98161 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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