Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBB4BP68371 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBB4BP68371 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms