Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms