Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW4P57775 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms