Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP12AP54707 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms