Protein–RNA interactions for Protein: P51164

ATP4B, Potassium-transporting ATPase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4BP51164 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4BP51164 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4BP51164 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4BP51164 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4BP51164 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4BP51164 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms