Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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CASQ1P31415 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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