Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC018695.4-201ENST00000602706 689 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC073578.4-201ENST00000623945 514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms