Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y4

KRTAP1-4, Keratin-associated protein 1-4, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-4P0C5Y4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP1-4P0C5Y4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms