Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLK3P07288 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLK3P07288 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms