Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTMAP06454 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTMAP06454 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTMAP06454 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTMAP06454 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTMAP06454 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTMAP06454 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTMAP06454 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTMAP06454 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTMAP06454 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTMAP06454 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTMAP06454 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTMAP06454 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms