Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYBBP04839 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYBBP04839 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYBBP04839 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms