Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMUO75648 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms